L'IR appliquera des méthodes de pointe pour analyser des données de séquençage haut débit, dans le cadre du projet IMHOTEP.
Activités
- Utiliser les pipelines bioinformatiques automatisés
- Générer des données de génomique et transcriptomique et produire des figures d'analyse (heatmaps, barplots, PCA, etc.)
- Interpréter les modèles et proposer des hypothèses
- Effectuer régulièrement une veille technologique dans la littérature scientifique
- Proposer des activités ou des outils innovants à tester
- Présenter les données : réunions de laboratoire, séminaires en anglais.
- Participer à la rédaction de rapports scientifiques et de publications
- Participer à l'encadrement et à la formation de stagiaires.
Compétences
- Connaissances en bioinformatique et biologie des cancers
- Expertise en cancer présentant une instabilité des microsatellites, biologie moléculaire et séquençage de nouvelle génération
- Expérience des outils et pipelines bioinformatiques pour l'analyse de RNAseq, WES et intégration de données
- -Maîtrise des langages de programmation pertinents (ex : Python, R)
- Bonnes capacités de gestion et manipulation de données
- Aptitudes démontrées en communication, organisation, résolution de problèmes
- Bonne maîtrise de la langue anglaise (oral et écrit)
Contexte de travail
Travail isolé